21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3494 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  100 
 
 
78 aa  164  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  67.95 
 
 
80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  67.11 
 
 
77 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  49.35 
 
 
77 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  49.3 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  47.95 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2323  putative ferredoxin  40.79 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  46.58 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  46.58 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 
290 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 
290 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 
293 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  39.73 
 
 
289 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  43.84 
 
 
299 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2964  putative ferredoxin  53.19 
 
 
48 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184852  normal  0.107034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  38.89 
 
 
304 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  44.07 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  36.84 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.48 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.33 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.33 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>