22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0824 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  58.21 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  39.71 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  44.62 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  42.19 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  36.23 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  40.98 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  36.11 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  34.85 
 
 		 599 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  32.43 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  44.93 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  33.33 
 
 		 508 aa  40  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>