21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4594 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  98.68 
 
 		 76 aa  160  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  98.68 
 
 		 76 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  98.68 
 
 		 76 aa  160  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  97.37 
 
 		 76 aa  157  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  82.89 
 
 		 76 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  43.94 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  37.7 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  40.98 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  37.7 
 
 		 508 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  43.75 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  32.79 
 
 		 599 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  31.75 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>