21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4680 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  98.68 
 
 
76 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  98.68 
 
 
76 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  98.68 
 
 
76 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  97.37 
 
 
76 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  97.37 
 
 
76 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  97.37 
 
 
76 aa  157  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  84.21 
 
 
76 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  52.78 
 
 
89 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 
77 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  37.7 
 
 
211 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  36.07 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  40.98 
 
 
211 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  37.7 
 
 
508 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  33.8 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  32.79 
 
 
599 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  31.75 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>