20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0714 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  188  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  54.17 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  52.78 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  53.52 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  53.52 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  43.28 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  40.96 
 
 
214 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  35.56 
 
 
211 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  39.71 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  32.5 
 
 
508 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  37.7 
 
 
211 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 
599 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  35 
 
 
215 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  31.34 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.650422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>