21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2660 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 
77 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  54.05 
 
 
214 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  58.21 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  46.97 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  43.84 
 
 
508 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  45.45 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  43.28 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  28.95 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  41.94 
 
 
211 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  42.19 
 
 
211 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  42.25 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1270  hypothetical protein  38.71 
 
 
215 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  33.82 
 
 
599 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>