85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1696 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  78.46 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  77.95 
 
 		 195 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  77.44 
 
 		 195 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  77.44 
 
 		 195 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  77.44 
 
 		 195 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  78.46 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  320  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  320  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  320  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  75.9 
 
 		 195 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  75.38 
 
 		 195 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  74.87 
 
 		 195 aa  316  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  74.36 
 
 		 195 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  61.46 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  61.46 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  63.02 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  62.5 
 
 		 199 aa  245  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  62.5 
 
 		 199 aa  245  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  59.69 
 
 		 211 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  58.64 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  58.64 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  59.79 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  60.94 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  60.94 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  60.94 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  63.02 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  59.16 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  59.38 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  49.21 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.22 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  44.74 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  42.63 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  42.05 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  38.34 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  53.33 
 
 		 144 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  65.93 
 
 		 108 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  35.53 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  38.96 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  27.42 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  26.94 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 349 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  25.26 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  31.54 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  31.17 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  29.17 
 
 		 405 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  31.53 
 
 		 396 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  30.17 
 
 		 406 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  28.33 
 
 		 412 aa  42.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  22.6 
 
 		 360 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  32.74 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>