49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1938 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
360 aa  719    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
349 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  25.42 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  24.04 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  24.16 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  22.56 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  22.93 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  22.18 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  22.82 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  23.78 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  22.07 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  22.07 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  22.07 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  22.59 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  30.72 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 
423 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  28.21 
 
 
412 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  32.47 
 
 
416 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  26.11 
 
 
201 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  30.43 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  34.62 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 
205 aa  47.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  29.73 
 
 
214 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
205 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 
202 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
203 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  25.52 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
203 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
200 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  24.02 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  25.32 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
203 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  23.6 
 
 
195 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  25.32 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  25.32 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  25.32 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  25.32 
 
 
199 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  24.62 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  21.18 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  21.18 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
199 aa  43.1  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
210 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  22.7 
 
 
195 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>