102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0325 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  420  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  61.62 
 
 
193 aa  241  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  61.62 
 
 
193 aa  241  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  52.38 
 
 
206 aa  188  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  52.06 
 
 
209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 
201 aa  178  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  49.46 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  45.08 
 
 
209 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  47.85 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  39.63 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
194 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  36.5 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  30.3 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  30.3 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  29.55 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  28.28 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  30.3 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  31.49 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 
222 aa  54.7  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  29.55 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  29.55 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  31.39 
 
 
192 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  32.33 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
224 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  29.93 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  25.33 
 
 
223 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  28.49 
 
 
199 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  28.15 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
254 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  28.15 
 
 
388 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  36.99 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  29.91 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  31.17 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  31.08 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  34.29 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  28.39 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  27.92 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  27.38 
 
 
199 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  27.87 
 
 
199 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  27.5 
 
 
199 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
196 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 
374 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>