87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2009 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  75.39 
 
 
210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  72.4 
 
 
207 aa  295  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  74.47 
 
 
209 aa  291  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  70.37 
 
 
209 aa  280  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  57.53 
 
 
201 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
193 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
193 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  52.38 
 
 
202 aa  188  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
196 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
194 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  32.33 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
157 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  30.83 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  31.06 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  30.15 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  31.62 
 
 
201 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  28.96 
 
 
388 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  28.57 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
196 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  29.49 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  24.18 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  25.76 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
202 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  26.98 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
192 aa  45.1  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  24.82 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  26.9 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  26.46 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  26.92 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  27.59 
 
 
195 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>