82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003167 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  87.69 
 
 
195 aa  354  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  51.04 
 
 
214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  51.31 
 
 
196 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 
222 aa  204  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  48.96 
 
 
203 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  47.59 
 
 
196 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  52.17 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  48.11 
 
 
202 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  47.42 
 
 
197 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
224 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  44.27 
 
 
208 aa  181  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  46.88 
 
 
201 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 
191 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  47.85 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 
191 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  47.4 
 
 
208 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  47.31 
 
 
202 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
197 aa  170  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
202 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  45.05 
 
 
388 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
209 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  44.81 
 
 
194 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  44.81 
 
 
194 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  45.36 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 
201 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 
201 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 
374 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  39.79 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
205 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  40.8 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  33.85 
 
 
200 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  32.82 
 
 
200 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  40.16 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  33.11 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  29.79 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  28.42 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  34.11 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2101  putative metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
96 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233196  normal  0.0495864 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  27.07 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  23.85 
 
 
223 aa  51.2  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
186 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  27.83 
 
 
199 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>