80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3325 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  58.25 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  47.42 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  184  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  46.88 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  47.89 
 
 		 214 aa  177  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  44.92 
 
 		 202 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  48.33 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 		 202 aa  164  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  42.19 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  44.15 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  47.78 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  41.24 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.46 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  45.05 
 
 		 388 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 374 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  45.3 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  42.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  43.58 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  43.58 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  34.03 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  34.03 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  32.64 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  32.64 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  32.64 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  32.64 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  31.94 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  34.03 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  32.92 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  35.81 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  32.67 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2101  putative metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233196  normal  0.0495864 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  30.56 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  29.25 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  24.07 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  23.49 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  22.52 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  32.65 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>