98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2366 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  83.51 
 
 
194 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  82.99 
 
 
194 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  61.38 
 
 
374 aa  224  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  57.75 
 
 
388 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  51.6 
 
 
224 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  51.35 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
209 aa  184  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  52.1 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  50.27 
 
 
201 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 
214 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  50.27 
 
 
208 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  47.15 
 
 
207 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  45.36 
 
 
195 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  45.9 
 
 
195 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  39.25 
 
 
208 aa  154  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
216 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  45.66 
 
 
196 aa  148  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 
202 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  42.46 
 
 
197 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
202 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
202 aa  141  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
202 aa  141  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
191 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 
191 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  32.98 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  32.98 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  32.98 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  34.42 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  32.29 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  33.77 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  27.42 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  28.19 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  32.24 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  29.05 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  30.46 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  31.58 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  31.58 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  33.33 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  22.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  24.56 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 
196 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  31.11 
 
 
199 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  34.75 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  30.18 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  25.84 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  26.29 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  26.29 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  26.29 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  25.84 
 
 
199 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  31.4 
 
 
199 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
209 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2101  putative metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 
96 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233196  normal  0.0495864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>