85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0261 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  51.55 
 
 
205 aa  221  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  50.53 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
202 aa  204  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
205 aa  201  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  49.22 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  46.35 
 
 
199 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  48.68 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  48.68 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  47.15 
 
 
197 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  46.03 
 
 
195 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  47.15 
 
 
197 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  47.15 
 
 
197 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  45.5 
 
 
195 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  44.97 
 
 
195 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  45.5 
 
 
195 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  43.92 
 
 
195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  48.45 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  45.03 
 
 
199 aa  188  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  44.68 
 
 
195 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  43.92 
 
 
195 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  43.92 
 
 
195 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  43.92 
 
 
195 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  187  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  45.5 
 
 
195 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  45.03 
 
 
206 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  44.44 
 
 
195 aa  185  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  184  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  45.03 
 
 
233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  47.69 
 
 
199 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  46.43 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
205 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 
199 aa  167  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.05 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  131  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  37.11 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  30.53 
 
 
217 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  44.94 
 
 
108 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  38.98 
 
 
144 aa  89  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  29.74 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  24.85 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 
216 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 
216 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  24.4 
 
 
213 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
217 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 
214 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  25.44 
 
 
214 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 
349 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
224 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  30.14 
 
 
201 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  25.36 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 
396 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 
194 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21271  hypothetical protein  26.53 
 
 
484 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>