28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0396 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
396 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  56.46 
 
 
396 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  47.99 
 
 
403 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  46.1 
 
 
412 aa  361  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  44.74 
 
 
411 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  45.41 
 
 
405 aa  354  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  45.43 
 
 
408 aa  353  4e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  46.46 
 
 
406 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  44.81 
 
 
408 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  45.83 
 
 
408 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  45.57 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  41.18 
 
 
413 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  40.44 
 
 
412 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  39.15 
 
 
416 aa  289  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  38.48 
 
 
413 aa  285  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  40.26 
 
 
413 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  38.21 
 
 
398 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  33.25 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  23.88 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  26.47 
 
 
201 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 
196 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
199 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  31.3 
 
 
206 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  31.53 
 
 
195 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>