92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0292 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  51.55 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 202 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  49.25 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  45.59 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  47.74 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  46.46 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  46.46 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  44.12 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  43.94 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  44.16 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  43.15 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  42.64 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  42.64 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  42.64 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  41.38 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  43.65 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  41.58 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  44.16 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  43.37 
 
 		 195 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  43.88 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  43.65 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  42.36 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  41.33 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  42.35 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  40.31 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  41.41 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  41.41 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  41.41 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  41.41 
 
 		 195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  41.41 
 
 		 195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  40.91 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  39.09 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  39.59 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  33 
 
 		 217 aa  111  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  34.65 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  41.11 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  34.68 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  29.52 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  27.13 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  30.95 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  25.45 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  29.66 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  25.93 
 
 		 396 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  28.46 
 
 		 403 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  24.82 
 
 		 411 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 182 aa  48.5  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  25.66 
 
 		 412 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  22.83 
 
 		 408 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  30.51 
 
 		 388 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  24.17 
 
 		 406 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  26.55 
 
 		 416 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  24.23 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 250 aa  42  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 196 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  24.35 
 
 		 413 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  25.34 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  22.31 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 360 aa  41.2  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>