42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0006 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  74.14 
 
 		 412 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  100 
 
 		 406 aa  833    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  75.06 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  71.32 
 
 		 408 aa  577  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  70.59 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  71.08 
 
 		 408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  71.32 
 
 		 408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  66.17 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  60.44 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  46.46 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  39.7 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  34.69 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  36.82 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  34.87 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  36.63 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  34.89 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  35.98 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  35.56 
 
 		 398 aa  216  8e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  30.99 
 
 		 396 aa  209  9e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  22.31 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 		 359 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  28.83 
 
 		 195 aa  53.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  32.52 
 
 		 195 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  31.9 
 
 		 195 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 199 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  31.71 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  31.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  24.29 
 
 		 195 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  30.17 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  24.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  30.91 
 
 		 195 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  30.91 
 
 		 195 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  30.91 
 
 		 195 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  30.48 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>