25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0042 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  84.07 
 
 
408 aa  689    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  99.75 
 
 
408 aa  827    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  830    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  99.51 
 
 
408 aa  825    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  73.71 
 
 
411 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  71.57 
 
 
412 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  71.32 
 
 
406 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  65.69 
 
 
405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  63.5 
 
 
403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  45.57 
 
 
396 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  44.62 
 
 
396 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  37.28 
 
 
416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  36.75 
 
 
412 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  35.2 
 
 
413 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  34.16 
 
 
423 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  35.14 
 
 
413 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  33.67 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  34.63 
 
 
398 aa  212  9e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  31.39 
 
 
396 aa  206  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  22.3 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  22.07 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  31.53 
 
 
195 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  29.66 
 
 
201 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  25.9 
 
 
199 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>