114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0827 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  59.07 
 
 
201 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  50.26 
 
 
211 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  198  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  198  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  48.19 
 
 
199 aa  197  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 
196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  48.19 
 
 
199 aa  193  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  48.19 
 
 
199 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  48.19 
 
 
199 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  47.15 
 
 
206 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  46.63 
 
 
215 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  188  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
205 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  47.69 
 
 
205 aa  187  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 
193 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  47.67 
 
 
199 aa  187  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  47.15 
 
 
199 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  47.15 
 
 
199 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  47.15 
 
 
199 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  47.15 
 
 
199 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  47.15 
 
 
199 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  47.15 
 
 
199 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 
205 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  44.21 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  44.56 
 
 
233 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
199 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 
202 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  43.16 
 
 
195 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  43.16 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  41.58 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  43.16 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  41.58 
 
 
195 aa  168  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  41.05 
 
 
195 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  41.05 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  41.05 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  41.05 
 
 
195 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  40.53 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  42.63 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  40.41 
 
 
197 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 
195 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  39.58 
 
 
217 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  42.02 
 
 
144 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  50 
 
 
108 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  31.25 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  29.03 
 
 
405 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
349 aa  54.7  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  31.53 
 
 
403 aa  54.7  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  30.63 
 
 
408 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  31.53 
 
 
408 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  25.53 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  31.53 
 
 
408 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  28.83 
 
 
406 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
216 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
216 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  28.83 
 
 
408 aa  51.2  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  29.29 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  27.03 
 
 
412 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  27.03 
 
 
411 aa  48.9  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  30.22 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  21.88 
 
 
214 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  26.4 
 
 
396 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.26 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  24.36 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  35.14 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
191 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  38.03 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>