103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01071 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  66.49 
 
 
211 aa  286  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  70.26 
 
 
199 aa  286  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  69.74 
 
 
199 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  69.07 
 
 
199 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  69.07 
 
 
199 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  67.69 
 
 
197 aa  277  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  67.69 
 
 
197 aa  277  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  67.69 
 
 
197 aa  277  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  67.53 
 
 
199 aa  275  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  65.64 
 
 
199 aa  270  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  67.71 
 
 
206 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  67.19 
 
 
215 aa  266  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  64.06 
 
 
233 aa  265  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  63.54 
 
 
195 aa  255  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  254  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  63.02 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  63.54 
 
 
195 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  62.5 
 
 
195 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  60.94 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  242  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  61.46 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  63.02 
 
 
195 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  60.42 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  51.79 
 
 
196 aa  217  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  53.09 
 
 
205 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  51.78 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  77.87 
 
 
144 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
202 aa  184  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
202 aa  181  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  46.32 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 
193 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  43.08 
 
 
197 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  40.82 
 
 
197 aa  151  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
205 aa  150  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.84 
 
 
195 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  82.89 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  37.95 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  34.17 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  26.78 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  25 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  28.95 
 
 
406 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 
396 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  26.05 
 
 
412 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
177 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
359 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  27.73 
 
 
405 aa  45.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  25.21 
 
 
411 aa  45.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  24.81 
 
 
408 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  24.06 
 
 
408 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  26.71 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  27.33 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  27.4 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  22.34 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  24.06 
 
 
408 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  25 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  24.06 
 
 
408 aa  41.6  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  24.43 
 
 
403 aa  42  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>