90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2952 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  78.16 
 
 
210 aa  342  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  75.12 
 
 
209 aa  325  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  72.4 
 
 
206 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  67.37 
 
 
209 aa  269  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  58.03 
 
 
201 aa  241  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 
193 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  47.85 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 
196 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
194 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  32.84 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  25.26 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 
177 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  28.07 
 
 
388 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  27.16 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  30.48 
 
 
194 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
199 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  29.95 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  29.2 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
222 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  28.26 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  24.07 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  29.5 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  25.36 
 
 
223 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  28 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  27.61 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  25.31 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2290  hypothetical protein  29.5 
 
 
305 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00991929  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  30.82 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  26.53 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
374 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  34.11 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  30.43 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
201 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
196 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  31.25 
 
 
195 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  31.51 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>