90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5343 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  72.68 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  59.07 
 
 
201 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  51.83 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
222 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  45.64 
 
 
203 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  47.59 
 
 
196 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  46.39 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  47.42 
 
 
195 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  49.21 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
197 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  44.5 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  42.23 
 
 
202 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
202 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  45.16 
 
 
202 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  44.5 
 
 
197 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  49.22 
 
 
194 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  48.7 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  50.87 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  48.68 
 
 
224 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
201 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
201 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  47.15 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  43.78 
 
 
196 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 
374 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  42.33 
 
 
388 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
191 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
214 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  37.09 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  36.42 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  35.76 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  37.09 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  35.76 
 
 
200 aa  88.2  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  35.76 
 
 
200 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  34 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  34 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  34 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  34 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  34 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  34.23 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  30.59 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  35.95 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  35.95 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.032702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  29.81 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  34.59 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  32.09 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2101  putative metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
96 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233196  normal  0.0495864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  32.62 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  23.7 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0429  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267133  normal  0.110289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 
157 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>