122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3021 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  61.62 
 
 
202 aa  241  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
206 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 
210 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  46.49 
 
 
209 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 
201 aa  168  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
196 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
193 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  31.29 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  34.19 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  34.44 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06188  HD family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11680)  25 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
222 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
191 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  28.95 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  32.03 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  30.37 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  30.92 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  32.26 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  28.19 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  30.07 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  29.61 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  31.37 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  30.07 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  30.07 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  30.07 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  30.26 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
205 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  31.28 
 
 
197 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  31.28 
 
 
197 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  31.28 
 
 
197 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  29.07 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  28.25 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  29.67 
 
 
233 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  27.52 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  28.76 
 
 
195 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  32.68 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  27.86 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1178  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.30163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  29.05 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  30.67 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  27.56 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>