126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0787 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  95.81 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3308  metal dependent phosphohydrolase  48.69 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3901  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0635  metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3433  metal dependent phosphohydrolase  49.21 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0849  metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  44.79 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  44.27 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2750  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3325  hypothetical protein  46.11 
 
 		 197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3043  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0276  HD domain-containing protein  43.24 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3189  metal-dependent phosphohydrolase  46.82 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3513  metal dependent phosphohydrolase  46.82 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  47.19 
 
 		 196 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3216  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  43.1 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5343  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.734544  normal  0.114222 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2960  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 		 374 aa  141  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  42.94 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  39.57 
 
 		 388 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.48 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2366  HD superfamily hydrolase-like protein  39.88 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0445  hypothetical protein  39.88 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  39.88 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2176  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3654  hypothetical protein  32.59 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1339  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.616198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0400  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1692  hypothetical protein  32.59 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0821  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2197  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000428773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0037  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0113242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0944  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0851  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1584  HD domain-containing protein  30.23 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1802  hypothetical protein  31.85 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1724  hypothetical protein  31.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1745  hypothetical protein  31.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1538  hypothetical protein  31.85 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1514  HAD superfamily hydrolase  31.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1503  HAD superfamily hydrolase  31.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1657  hypothetical protein  31.85 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1543  hypothetical protein  31.11 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3961  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0342  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0710  metal-dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0320  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3408  hypothetical protein  29.32 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4894  metal-dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4377  metal-dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482271  normal  0.0623525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40220  hypothetical protein  30.23 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0034  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  24.84 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  30.83 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3189  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3664  metal-dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12451  predicted protein  25.35 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  36.11 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42834  predicted protein  24.29 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0852302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2101  putative metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 		 96 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233196  normal  0.0495864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0727  metal-dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.287945  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3416  metal-dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.361337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4952  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.764591  normal  0.0584281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5334  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.032702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  30.36 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 		 250 aa  48.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>