78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2484 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  96.92 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  96.92 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  96.92 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  386  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  386  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  93.33 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  85.13 
 
 		 195 aa  358  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  82.56 
 
 		 195 aa  346  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  81.03 
 
 		 195 aa  339  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  79.49 
 
 		 195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  78.46 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  77.95 
 
 		 195 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  77.44 
 
 		 195 aa  323  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  60.73 
 
 		 233 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  59.69 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  250  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  61.98 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  61.98 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  61.98 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  61.98 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  61.98 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  60.42 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  60.42 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  60.42 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  60.94 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  58.76 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  240  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  240  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  59.16 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  58.64 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  56.77 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  50.53 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  50.78 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  48.69 
 
 		 196 aa  197  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  48.4 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  42.11 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  41.05 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  42.78 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  38.86 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  54.17 
 
 		 144 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  58.89 
 
 		 108 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  34.52 
 
 		 217 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  25.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  23.66 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  23.63 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  23.63 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  23.66 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 349 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  21.97 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  27.61 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  30.91 
 
 		 406 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 157 aa  42  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>