66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2033 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  100 
 
 		 108 aa  226  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  82.89 
 
 		 199 aa  139  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  68.89 
 
 		 195 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  77.33 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  64.13 
 
 		 199 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  74.67 
 
 		 199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  61.05 
 
 		 233 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  61.39 
 
 		 215 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  61.39 
 
 		 206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  74.32 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  74.32 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  74.32 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  69.62 
 
 		 211 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  63.04 
 
 		 199 aa  123  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  63.04 
 
 		 199 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  65.52 
 
 		 199 aa  122  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  64.37 
 
 		 199 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  64.44 
 
 		 195 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  64.37 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  59.18 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  62.22 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  65.93 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  62.22 
 
 		 195 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  61.11 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  60 
 
 		 195 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  63.33 
 
 		 195 aa  114  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  60 
 
 		 195 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  60 
 
 		 195 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.07 
 
 		 205 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  58.89 
 
 		 195 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  58.89 
 
 		 195 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  60.81 
 
 		 205 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  56.58 
 
 		 202 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  53.75 
 
 		 202 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  55.26 
 
 		 201 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  90.5  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 		 193 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  50.55 
 
 		 197 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 195 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  49.33 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  33 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1931  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000883588  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2224  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2096  metal dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>