78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0131 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
205 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  35.38 
 
 
206 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  35.57 
 
 
199 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  35.32 
 
 
215 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  35.5 
 
 
211 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  35.03 
 
 
197 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  35.03 
 
 
197 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  35.03 
 
 
197 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  36.65 
 
 
199 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  34.52 
 
 
199 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  34.01 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  34.34 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  35.86 
 
 
199 aa  98.6  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  34.03 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  32.29 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  36.31 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  38.96 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  38.41 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  35.03 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  34.34 
 
 
195 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  34.34 
 
 
195 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  34.34 
 
 
195 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  34.34 
 
 
195 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  34.34 
 
 
195 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
202 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  35.8 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  34.01 
 
 
201 aa  92  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  33.14 
 
 
233 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  33.54 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  33.54 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  33.54 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  34.97 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  34.97 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  33.73 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  31.25 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
195 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  28.27 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  30.32 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
349 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  31.4 
 
 
144 aa  58.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 
359 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  29.09 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  30.28 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 
396 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  23.08 
 
 
411 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  30.72 
 
 
360 aa  49.3  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  28.69 
 
 
405 aa  48.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  33 
 
 
108 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  23.08 
 
 
412 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  30.23 
 
 
396 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  25.14 
 
 
403 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  23.22 
 
 
423 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  27.46 
 
 
408 aa  42  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  28.69 
 
 
413 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  29.63 
 
 
213 aa  41.6  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  33.93 
 
 
412 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>