90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3311 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  86.08 
 
 
197 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  86.08 
 
 
197 aa  358  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  86.08 
 
 
197 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  83.92 
 
 
199 aa  354  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  83.42 
 
 
199 aa  353  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  83.92 
 
 
199 aa  350  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  80.9 
 
 
199 aa  345  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  82.41 
 
 
199 aa  345  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  78.39 
 
 
199 aa  334  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  78.39 
 
 
199 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  78.39 
 
 
199 aa  332  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  69.04 
 
 
215 aa  299  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  69.04 
 
 
206 aa  297  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  68.53 
 
 
233 aa  295  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  66.49 
 
 
199 aa  286  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  255  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  251  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  57.59 
 
 
195 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  58.12 
 
 
195 aa  242  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  56.61 
 
 
196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  50.78 
 
 
205 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  50.26 
 
 
195 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.5 
 
 
205 aa  201  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  49.22 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  46.04 
 
 
202 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
202 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  44.85 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  41.33 
 
 
197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  57.98 
 
 
144 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  36.04 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  69.62 
 
 
108 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  35.5 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  26.32 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  25.79 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  24.34 
 
 
217 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
359 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  23.44 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  26.59 
 
 
398 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3522  HD superfamily metal-dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  27.52 
 
 
408 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  25.19 
 
 
408 aa  42.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  27.43 
 
 
405 aa  42.4  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2098  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272442  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  23.04 
 
 
396 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  26.55 
 
 
411 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
184 aa  41.2  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  26.43 
 
 
412 aa  41.2  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>