52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4333 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  82.27 
 
 		 207 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  80.88 
 
 		 205 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  80.69 
 
 		 211 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  78 
 
 		 210 aa  318  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  79 
 
 		 203 aa  317  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  78.33 
 
 		 203 aa  316  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  65.97 
 
 		 224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 		 210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  59.7 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  61.66 
 
 		 201 aa  231  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  64.21 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  60.51 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  57.82 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  58.59 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  58.25 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  59.79 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  56.5 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  56.5 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  57 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  53.5 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  65.19 
 
 		 194 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  64.56 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  65.82 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  57.3 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  55.96 
 
 		 202 aa  204  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  57.3 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 		 202 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  61.64 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  50.52 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.19 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  38.19 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  39.86 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  32.98 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  31.38 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  40.14 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  35.43 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.85 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  29.44 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  28.89 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  33.85 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 		 360 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  31.93 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>