47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1285 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  51.63 
 
 
247 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  39.77 
 
 
178 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  38.01 
 
 
178 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  41.76 
 
 
181 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  38.25 
 
 
264 aa  120  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  43.97 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  40.27 
 
 
282 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  36.67 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  37.14 
 
 
205 aa  87.8  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  31.22 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  31.41 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  30.89 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
225 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  31.05 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  30.16 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.42 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  28.88 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  28.88 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  28.88 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1357  hypothetical protein  61.36 
 
 
70 aa  61.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.647327  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  26.53 
 
 
220 aa  44.7  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>