55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0225 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  53.23 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  52.5 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  55.38 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  50.25 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  53.68 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  53.16 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  52.6 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  52.53 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  52.53 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  54.82 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  50.78 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  49.5 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  50.25 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  50.99 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  51.79 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  48.47 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  50.52 
 
 		 205 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  48.72 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  52.11 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  49.75 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  49.75 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  49.74 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  54.94 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  53.01 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  50.49 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  54.32 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  48.97 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  47.74 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  54.43 
 
 		 194 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  54.43 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  52.15 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.39 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.61 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  39.39 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  38.76 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  31.61 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  31.38 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  31.38 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  35.42 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  31.49 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  38.39 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  31.54 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>