49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3429 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  80.31 
 
 
202 aa  324  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  77.89 
 
 
198 aa  307  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  76.32 
 
 
194 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  75.79 
 
 
194 aa  297  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  74.47 
 
 
197 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  71.2 
 
 
202 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  60.11 
 
 
206 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  67.7 
 
 
203 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  57.14 
 
 
206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  57.14 
 
 
206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  59.04 
 
 
203 aa  227  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  58.16 
 
 
209 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  59.24 
 
 
201 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  56.54 
 
 
202 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  57.22 
 
 
202 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  54.87 
 
 
215 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  65.45 
 
 
225 aa  210  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  56.91 
 
 
198 aa  208  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  63.92 
 
 
211 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  60.23 
 
 
210 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  60 
 
 
207 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  61.82 
 
 
224 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  62.66 
 
 
205 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  62.42 
 
 
207 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  64.56 
 
 
203 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  61.64 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  62.66 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  54.68 
 
 
210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  62.35 
 
 
208 aa  197  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  61.49 
 
 
208 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  58.82 
 
 
186 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  54.32 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.89 
 
 
223 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  46.91 
 
 
220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  41.61 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  42.24 
 
 
174 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  41.27 
 
 
247 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  33.85 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  38.71 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  40.56 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.16 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  37.06 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  30.71 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  30.71 
 
 
178 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  37.59 
 
 
282 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  35.43 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  34.65 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>