51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4675 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
208 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  97.12 
 
 
208 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  91.54 
 
 
210 aa  362  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  73.06 
 
 
225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  70.47 
 
 
207 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  73.94 
 
 
186 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  60 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  61.76 
 
 
211 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  60 
 
 
207 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  62.11 
 
 
210 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  60.78 
 
 
203 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  59.8 
 
 
203 aa  221  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  59.79 
 
 
205 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  58.94 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  58.94 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  58.82 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  59.28 
 
 
201 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  58.42 
 
 
203 aa  208  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  58.46 
 
 
215 aa  208  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  58.88 
 
 
224 aa  207  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  57.43 
 
 
202 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  56.37 
 
 
203 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  56.37 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  55 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  59.59 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  59.28 
 
 
197 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  59.07 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  61.49 
 
 
202 aa  193  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  55.73 
 
 
198 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  56.72 
 
 
202 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  54.95 
 
 
198 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  58.33 
 
 
202 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  49.75 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.61 
 
 
220 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
220 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.15 
 
 
223 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  45.22 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  35.32 
 
 
174 aa  91.3  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  39.44 
 
 
181 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  33.68 
 
 
247 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.81 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  35.93 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  39.35 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  29.84 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  37.58 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  31.88 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  36.43 
 
 
282 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  36.69 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  36.69 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  29.66 
 
 
206 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>