50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1235 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  91.04 
 
 		 211 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  86.57 
 
 		 205 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  82.27 
 
 		 205 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  83.51 
 
 		 210 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  82.32 
 
 		 203 aa  323  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  79.8 
 
 		 203 aa  314  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  65.17 
 
 		 224 aa  257  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  65.46 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  64.43 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  60.49 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  64.21 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  62.37 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  58.79 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  60.49 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  61.19 
 
 		 215 aa  231  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  60 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  61.27 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  61.11 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  59.47 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  59.47 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  57.44 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  56.63 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  66.88 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  66.24 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  58.6 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  67.52 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  56.35 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  55.21 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  59.57 
 
 		 186 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  60 
 
 		 202 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  56.28 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  50.78 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.59 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  38.61 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  39.61 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  40.91 
 
 		 174 aa  91.7  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  32.98 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  34.12 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  39.73 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  36.29 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.32 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  35.04 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  30.19 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  26.06 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>