50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6186 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
225 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  88.38 
 
 
207 aa  341  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  73.71 
 
 
210 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  73.06 
 
 
208 aa  272  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  73.58 
 
 
208 aa  272  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  62.94 
 
 
206 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  62.94 
 
 
206 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  63.27 
 
 
203 aa  238  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  64.43 
 
 
207 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 
205 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  64.71 
 
 
210 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  67.57 
 
 
186 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  65.45 
 
 
211 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  62.94 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  65.46 
 
 
203 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 
205 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  63.27 
 
 
224 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  62.24 
 
 
203 aa  224  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  63.02 
 
 
203 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  60 
 
 
202 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  58.25 
 
 
215 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  58.29 
 
 
201 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  58.97 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  58.29 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  61.38 
 
 
198 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  65.45 
 
 
202 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  63.8 
 
 
202 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  64.33 
 
 
194 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  63.74 
 
 
194 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  66.67 
 
 
197 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  62.42 
 
 
198 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  58.85 
 
 
202 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  54.82 
 
 
224 aa  184  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.65 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 
220 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.79 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  35.38 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  41.18 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  36.8 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  38.41 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  39.86 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  34.88 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.65 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  31.44 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  31.63 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  38.84 
 
 
282 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  35.61 
 
 
179 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  35.61 
 
 
179 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>