51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1516 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  98.97 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  90.72 
 
 		 197 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  75.52 
 
 		 202 aa  303  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  76.32 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  75.13 
 
 		 202 aa  292  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  71.88 
 
 		 198 aa  281  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  65.54 
 
 		 209 aa  231  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  61.29 
 
 		 203 aa  230  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  60.73 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  60.11 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  59.04 
 
 		 206 aa  227  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  59.04 
 
 		 206 aa  227  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  59.24 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  59.24 
 
 		 201 aa  218  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  59.56 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  66.88 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  66.88 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  65.19 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  60.23 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  65.82 
 
 		 203 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  65.61 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  65.19 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  58.7 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  56.54 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  63.75 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  64.33 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  60 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  59.07 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  59.59 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  62.89 
 
 		 207 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  59.87 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  54.43 
 
 		 224 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  44.65 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  43.51 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  43.1 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  39.52 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  36.22 
 
 		 264 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  34.08 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  31.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  37.69 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  38.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  36.94 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  34.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  34.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  28 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  28 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  30.82 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>