49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6705 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  88.38 
 
 
225 aa  343  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  71.65 
 
 
210 aa  267  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  70.47 
 
 
208 aa  261  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  70.47 
 
 
208 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  65.46 
 
 
207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  65.46 
 
 
211 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  62.63 
 
 
206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  62.63 
 
 
206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  63.21 
 
 
210 aa  236  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  61.81 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  65.64 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  62.12 
 
 
205 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  64.58 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  62.56 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  62.89 
 
 
203 aa  231  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  66.85 
 
 
186 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  64.8 
 
 
224 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  60.62 
 
 
209 aa  228  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  59.5 
 
 
215 aa  227  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  60.1 
 
 
202 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  60.1 
 
 
202 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  60.1 
 
 
201 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  60 
 
 
203 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  60.33 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  62.42 
 
 
202 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  62.58 
 
 
202 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  61.9 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  56.63 
 
 
202 aa  197  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  63.52 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  62.89 
 
 
194 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  62.89 
 
 
194 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  55.38 
 
 
224 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.26 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
220 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.3 
 
 
220 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
220 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  33.5 
 
 
247 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  40.34 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  36.27 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  39.19 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.3 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  37.3 
 
 
181 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  39.82 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  31.25 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  35.61 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  35.61 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  36.36 
 
 
282 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>