50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2836 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  80.31 
 
 		 202 aa  324  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  75.76 
 
 		 198 aa  320  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  75.52 
 
 		 194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  75 
 
 		 194 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  76.6 
 
 		 197 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  71.28 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  62.83 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  62.83 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  61.58 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  70.19 
 
 		 203 aa  238  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  59.9 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  61.34 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  60.53 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  57.81 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  55.22 
 
 		 215 aa  217  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  57.59 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  63.58 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  55.21 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  63.8 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  60.36 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  61.68 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  55.96 
 
 		 205 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  61.01 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  57.3 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  62.58 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  52.5 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  61.01 
 
 		 224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  53.77 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  59.88 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  58.33 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  54.94 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  51.32 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.81 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  43.11 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  43.1 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  39.52 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  34.22 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  34.07 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  30.2 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  38.1 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  38.74 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  37.6 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  36.8 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  28.8 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  28.8 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 360 aa  45.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>