42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2778 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  67.66 
 
 
220 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  56.41 
 
 
223 aa  208  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  58.25 
 
 
220 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  47.47 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
207 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  40.61 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  45.22 
 
 
208 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
208 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
203 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.8 
 
 
224 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
225 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  42.68 
 
 
206 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  42.68 
 
 
206 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
211 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  41.51 
 
 
202 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 
186 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  36.23 
 
 
206 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  40.26 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  40.88 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  40.51 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  38.75 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  38.71 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  45.83 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  40.83 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  32.14 
 
 
174 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  34.01 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>