49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3991 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  45.29 
 
 		 264 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  40.94 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  39.77 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  44.57 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  41.52 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  44.25 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  47.76 
 
 		 174 aa  121  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  44.25 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  41.71 
 
 		 205 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  34.32 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 		 208 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 		 208 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 203 aa  87.4  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  39.68 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  41.46 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  41.46 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  34.09 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  39.67 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  42.73 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  40.91 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  38.02 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  31.79 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  35.9 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  34.62 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  38.79 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.59 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.71 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>