52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2783 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  76.02 
 
 
197 aa  297  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  75.13 
 
 
194 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  74.61 
 
 
194 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  71.28 
 
 
202 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  69.74 
 
 
198 aa  278  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  71.2 
 
 
202 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  64.4 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  59.36 
 
 
203 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  56.48 
 
 
206 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  56.48 
 
 
206 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  56.48 
 
 
206 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  59.56 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  56.54 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  56.38 
 
 
215 aa  208  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  56.35 
 
 
207 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  62.11 
 
 
205 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  55.79 
 
 
202 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  58.16 
 
 
203 aa  205  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  62.11 
 
 
211 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  55.44 
 
 
202 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  56.54 
 
 
224 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  61.25 
 
 
210 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  64.1 
 
 
205 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  63.75 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  58.85 
 
 
225 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  58.08 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  56.63 
 
 
207 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  57.79 
 
 
208 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  56.72 
 
 
208 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  53.97 
 
 
186 aa  177  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  47.74 
 
 
224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.1 
 
 
220 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.71 
 
 
223 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  31.63 
 
 
188 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  42.02 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  33.52 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  34.83 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  34.22 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  38.85 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  39.55 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  35.43 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  35.43 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  29.13 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  29.13 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
360 aa  42  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
196 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  28.81 
 
 
195 aa  41.2  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>