52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4021 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  88.12 
 
 		 203 aa  358  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  80.39 
 
 		 211 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  78.22 
 
 		 205 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  82.32 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  79 
 
 		 205 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  76.38 
 
 		 210 aa  314  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  66.84 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  64.4 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  64.29 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  64.58 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  60.91 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  61.26 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  61.78 
 
 		 203 aa  230  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  61.05 
 
 		 206 aa  227  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  61.05 
 
 		 206 aa  227  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  59.8 
 
 		 202 aa  227  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  59.41 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  63.02 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  60.61 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  59.8 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  61.11 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  55.05 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  65.61 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  65.61 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  63.58 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  66.24 
 
 		 197 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  58.92 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  61.62 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  63.75 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  62.66 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  60.12 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  48.72 
 
 		 224 aa  175  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.71 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.6 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  43.22 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  34.04 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  38.02 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  39.04 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  35.48 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  39.19 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  29.47 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  38.74 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  25.89 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  28.33 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 360 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  29.29 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>