49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0705 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  83.25 
 
 		 202 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  81.68 
 
 		 202 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  76.41 
 
 		 215 aa  304  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  71.94 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  65.46 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  65.33 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  65.33 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  63.73 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  64.4 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  64.92 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  63.64 
 
 		 210 aa  237  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  63.02 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  64.21 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  62.23 
 
 		 203 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  62.77 
 
 		 209 aa  231  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  61.66 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  60.53 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  59.04 
 
 		 198 aa  224  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  59.24 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  61.98 
 
 		 224 aa  221  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  60.1 
 
 		 207 aa  221  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  59.78 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  59.26 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  58.29 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  59.24 
 
 		 194 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  61.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  58.97 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  56.54 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  58.76 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  59.28 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  57.84 
 
 		 186 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  53.16 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  42.64 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.75 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  40.85 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  37.06 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  34.69 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  40.85 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  37.68 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  31.05 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  39.09 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  27.38 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  25.77 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  28.42 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>