57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1461 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1164  putative hydrolase protein  77.66 
 
 		 202 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0817146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0705  hypothetical protein  76.41 
 
 		 201 aa  304  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864355  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1012  putative hydrolase protein  77.72 
 
 		 202 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0958  metal dependent phosphohydrolase  70.1 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0666  hypothetical protein  66.84 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0659  hypothetical protein  66.84 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2623  hypothetical protein  64.25 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1253  metal dependent phosphohydrolase  59.22 
 
 		 205 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.679773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0739  hypothetical protein  61.62 
 
 		 203 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  60.91 
 
 		 203 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1235  metal-dependent phosphohydrolase  61.19 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2706  metal dependent phosphohydrolase  60.1 
 
 		 203 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6705  metal-dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 		 207 aa  227  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4333  metal dependent phosphohydrolase  60.51 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1114  metal dependent phosphohydrolase  60.94 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0796  metal dependent phosphohydrolase  60.64 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2373  metal dependent phosphohydrolase  58.85 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.984657  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1475  metal dependent phosphohydrolase  60.94 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6186  metal-dependent phosphohydrolase  58.03 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0168  metal dependent phosphohydrolase  59.24 
 
 		 194 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1516  putative S-adenosyl L-homocystein hydrolase  59.24 
 
 		 194 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2836  metal dependent phosphohydrolase  55.22 
 
 		 202 aa  217  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3429  metal dependent phosphohydrolase  54.87 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2962  metal dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2898  metal dependent phosphohydrolase  60 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282677  normal  0.0112857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  57.95 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4073  metal dependent phosphohydrolase  56.5 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4306  metal-dependent phosphohydrolase  58.67 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  58.46 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2783  metal dependent phosphohydrolase  56.38 
 
 		 202 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0225  metal dependent phosphohydrolase, HD region  50.25 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3989  metal-dependent phosphohydrolase  55.98 
 
 		 186 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0285088  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1102  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.62 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1174  metal dependent phosphohydrolase, HD region  44.23 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4230  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2137  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2778  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3047  HD superfamily hydrolase  39.33 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6152  hypothetical protein  37.93 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2274  hypothetical protein  36.49 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.678144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3991  hypothetical protein  38.79 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554313  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1670  hypothetical protein  35.97 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1685  hypothetical protein  33.83 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1285  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2295  hypothetical protein  29.02 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  hitchhiker  1.38314e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1297  phage protein  26.94 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5538  hypothetical protein  28.16 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4441  hypothetical protein  29.53 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.395788  hitchhiker  0.0000000245131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  28.67 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  28.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  25.56 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>