83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1390 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  88.94 
 
 
199 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  87.94 
 
 
199 aa  361  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  86.93 
 
 
199 aa  357  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  82.41 
 
 
211 aa  345  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  83.51 
 
 
197 aa  337  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  83.51 
 
 
197 aa  337  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  83.51 
 
 
197 aa  337  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  79.4 
 
 
199 aa  333  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  78.89 
 
 
199 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  77.89 
 
 
199 aa  327  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  77.39 
 
 
199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  77.39 
 
 
199 aa  324  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  77.39 
 
 
199 aa  324  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  70.1 
 
 
206 aa  290  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  69.59 
 
 
215 aa  288  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  68.04 
 
 
233 aa  278  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  65.64 
 
 
199 aa  270  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  58.33 
 
 
195 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  57.81 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  59.38 
 
 
195 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  59.38 
 
 
195 aa  241  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  57.81 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  58.85 
 
 
195 aa  240  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  57.81 
 
 
195 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  56.77 
 
 
195 aa  234  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  56.25 
 
 
195 aa  231  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  56.25 
 
 
195 aa  231  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  56.25 
 
 
195 aa  231  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  230  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  230  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  230  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  55.73 
 
 
195 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  54.21 
 
 
196 aa  220  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  50.53 
 
 
205 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.49 
 
 
205 aa  201  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  49.47 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  48.19 
 
 
195 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  46.43 
 
 
193 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
202 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  46.7 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  44.15 
 
 
202 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  58.68 
 
 
144 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  37.31 
 
 
217 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  65.52 
 
 
108 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  34.34 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  26.59 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  25.53 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  27.39 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  24.16 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
359 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  29.91 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1461  hypothetical protein  28.68 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  26.22 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003167  predicted hydrolase  27.83 
 
 
195 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4880  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
222 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4021  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>