81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2775 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  97.99 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  87.94 
 
 		 199 aa  361  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  87.44 
 
 		 199 aa  360  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  83.92 
 
 		 211 aa  354  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  86.08 
 
 		 197 aa  351  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  86.08 
 
 		 197 aa  351  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  86.08 
 
 		 197 aa  351  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  339  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  81.91 
 
 		 199 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  79.9 
 
 		 199 aa  331  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  79.4 
 
 		 199 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  79.4 
 
 		 199 aa  328  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  79.4 
 
 		 199 aa  328  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  71.65 
 
 		 206 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  71.13 
 
 		 215 aa  290  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  69.59 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  69.74 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  59.9 
 
 		 195 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  60.42 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  60.42 
 
 		 195 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  61.46 
 
 		 195 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  60.42 
 
 		 195 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  59.9 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  59.9 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  59.9 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  61.46 
 
 		 195 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  58.33 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  58.33 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  54.17 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  52.11 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  47.89 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  48.68 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  48.19 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  48.47 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  47.18 
 
 		 202 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  45.92 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  60.33 
 
 		 144 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.54 
 
 		 195 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  36.08 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  64.37 
 
 		 108 aa  121  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  34.01 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  25.93 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  23.81 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  25 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 359 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  22.22 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 157 aa  48.1  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  23.76 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  25.19 
 
 		 408 aa  42.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0325  hypothetical protein  27.87 
 
 		 202 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.632910000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0579  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  24.4 
 
 		 398 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>