81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1906 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  88.21 
 
 		 195 aa  363  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  85.13 
 
 		 195 aa  358  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  84.62 
 
 		 195 aa  351  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  84.62 
 
 		 195 aa  351  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  84.62 
 
 		 195 aa  351  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  348  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  83.08 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  78.46 
 
 		 195 aa  329  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  78.97 
 
 		 195 aa  329  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  76.41 
 
 		 195 aa  316  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  74.87 
 
 		 195 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  74.36 
 
 		 195 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  60.42 
 
 		 199 aa  250  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  60.21 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  59.16 
 
 		 211 aa  247  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  59.38 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  59.79 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  60.73 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  59.9 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  59.9 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  59.9 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  59.69 
 
 		 206 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  60.42 
 
 		 199 aa  240  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  59.9 
 
 		 199 aa  240  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  58.85 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  59.38 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  59.38 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  57.81 
 
 		 199 aa  235  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  52.63 
 
 		 205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  48.94 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  41.58 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  43.81 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  43.3 
 
 		 197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  39.9 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  54.17 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  35.03 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  58.89 
 
 		 108 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  35.03 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  25.27 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  24.19 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 349 aa  51.6  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  26.09 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03649  predicted hydrolase  26.39 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3385  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  29.36 
 
 		 411 aa  43.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  29.84 
 
 		 412 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  26.79 
 
 		 405 aa  42.4  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  29.46 
 
 		 406 aa  42.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  30.84 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>