67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0423 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  89.1 
 
 		 216 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  89.1 
 
 		 216 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  56.99 
 
 		 212 aa  247  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  54.33 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  49.76 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  26.46 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  26.34 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  26.62 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  23.66 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  23.66 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  23.66 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  23.66 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  26.2 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  26.97 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  26.59 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  23.32 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  22.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  23.66 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  21.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  21.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  21.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  21.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  21.81 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  22.58 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  23.53 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  24.19 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  24.64 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  25.15 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  29.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  25.47 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 359 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  26.36 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  28.17 
 
 		 412 aa  45.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04670  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0368868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  21.56 
 
 		 360 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  29.63 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>