93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2359 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  58.55 
 
 
196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  53.72 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  50.52 
 
 
199 aa  214  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  50.78 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  50.79 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  51.31 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  52.36 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  52.36 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  52.36 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  52.36 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  52.36 
 
 
199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  52.63 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  52.11 
 
 
199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  49.76 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  51.04 
 
 
197 aa  211  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  51.04 
 
 
197 aa  211  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  51.04 
 
 
197 aa  211  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  50.51 
 
 
202 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  53.09 
 
 
199 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  52.63 
 
 
195 aa  208  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  50.52 
 
 
199 aa  207  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  50.53 
 
 
199 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  52.11 
 
 
215 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  51.58 
 
 
195 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  51.58 
 
 
195 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  51.58 
 
 
195 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  205  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  50.53 
 
 
195 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  48.95 
 
 
233 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  48.95 
 
 
195 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
193 aa  201  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  48.95 
 
 
195 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  48.42 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
205 aa  195  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  48.42 
 
 
195 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
205 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  46.07 
 
 
195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  41.88 
 
 
201 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  44.04 
 
 
197 aa  158  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  41.75 
 
 
197 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 
195 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  32.46 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  47.06 
 
 
144 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  60.81 
 
 
108 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  32.28 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  30.22 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  32.03 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  27.75 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
349 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  29.25 
 
 
217 aa  48.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1582  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
192 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.346306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0373  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  24.83 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0696  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0141  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  23.86 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0514  HD superfamily hydrolase  27.91 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0838  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
359 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42027  predicted protein  26.14 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156901  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0787  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5659  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  25.96 
 
 
408 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1237  HD domain-containing protein  30.19 
 
 
388 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  23.21 
 
 
412 aa  41.6  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  25.45 
 
 
406 aa  41.6  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>