96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004035 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  423  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  93.17 
 
 
215 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  79.29 
 
 
233 aa  338  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  69.04 
 
 
211 aa  297  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  72.16 
 
 
199 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  295  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  295  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  292  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  71.13 
 
 
199 aa  291  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  70.1 
 
 
199 aa  290  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  71.2 
 
 
197 aa  287  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  71.2 
 
 
197 aa  287  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  71.2 
 
 
197 aa  287  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  67.71 
 
 
199 aa  268  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  65.97 
 
 
195 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  62.83 
 
 
195 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  61.26 
 
 
195 aa  247  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  245  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  237  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  237  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  237  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  53.97 
 
 
196 aa  225  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  49.76 
 
 
205 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  45.83 
 
 
201 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
205 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  48.4 
 
 
202 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  47.15 
 
 
195 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
193 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  47.94 
 
 
197 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 
202 aa  184  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  45.92 
 
 
197 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  58.82 
 
 
144 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  37.56 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  61.39 
 
 
108 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  35.38 
 
 
201 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  26.06 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  24.64 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 
349 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  30 
 
 
412 aa  48.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2009  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  31.71 
 
 
406 aa  45.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  29.63 
 
 
398 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  31.3 
 
 
411 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3724  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 
359 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  31.36 
 
 
405 aa  42.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3311  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 
396 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5135  metal-dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01921  hypothetical protein  28.19 
 
 
195 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4166  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
186 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.589554  hitchhiker  0.00675893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4675  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
208 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4823  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
210 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  29.66 
 
 
408 aa  42  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3828  metal-dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 
224 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>